ник: osmor
1. В одном из файлов создаем связанную таблицу присоединяя таблицу из другого
2. строи запрос на обновление связывая таблицы inner join по фамилии, а для обновления указывая поле со статусом
3. запускам запрос.
MySql тоже умеет запросы на обновление создавать, так что скрипт не нужен, только запрос